Installation NetCDF4 mit HDF5

Download

Die Quellen für NetCDF kommen von UniData, die Quellen für HDF5 von The HDF group. Das lokale Verzeichnis für die C-Quellen ist $PROGHOME/C/lib/.

Installation

Überblick

Für NetCDF in der Version 4.1.2 liegen im Verzeichnis $PROGHOME/C/lib/netcdf/netcdf-4.1.2/ zwei README-Dateien, die zugleich die zentralen Installationsskripte darstellen. Ebenso für HDF5 im Verzeichnis $PROGHOME/C/lib/hdf5/:

• README.TXT für die Standard-Installation
• README_MPI.TXT für eine MPI-parallele Installation

Trotz der Dateiendung können beide Dateien direkt als Skript auf kronos ausgeführt werden. Sie setzen Umgebungsvariable und verzweigen dann in das Unterverzeichnis xe bzw. xe_mpi. Hier warten ein configure-Skript und ein Makefile auf die Verwendung durch das README-Skript, um die Installation durchführen zu können.

Archive

Nach erfolgreicher Installation stehen die folgenden Archive unter $PROGHOME/lib/xe/netcdf4.1.2/lib/ zur Verfügung:

• libnetcdf
• libnetcdff : Fortran-Schnittstelle für NetCDF
• libnetcdf_c++4 : C++ Schnittstelle für NetCDF-Version 4
• libnetcdf_c++ : C++ Schnittstelle für NetCDF

Zusätzliche Pakete

Die Umgebungsvariable $netcdf listet alle zum Linken eines Executables notwendigen Archive. Zusätzlich zu NetCDF werden die folgenden Pakete eingebunden:

• HDF5 (Version 1.8.6) Installationsverzeichnis $PROGHOME/lib/xe/hdf5-1.8.6/lib
  • Archiv libhdf5_hl.a
  • Archiv libhdf5.a
• CURL (Version 7.21.6) Installationsverzeichnis $PROGHOME/lib/xe/curl-7.21.6/lib
  • Archiv libcurl.a
• ZLIB Installationsverzeichnis $PROGHOME/lib/linux/zlib/lib
  • Archiv libz.a

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Strukturübersicht