NetCDF Operators - Versionsgeschichte

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2022-10-21T09:48:31Z

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Zeile 19:		Zeile 19:

	===Verketten mehrerer zeitlich aufeinanderfolgender [[NetCDF]]-Dateien===		===Verketten mehrerer zeitlich aufeinanderfolgender [[NetCDF]]-Dateien===
	* Ausgabezeitpunkte und -indices ermitteln aus [[UNTRIM\|UnTRIM]]-sdr-Ausgabe, UnTRIM-Steuerdatei und dem Header der [[NetCDF]]-Datei (ncdump -h)		* Ausgabezeitpunkte und -indices ermitteln aus [[UNTRIM\|UnTRIM]]-sdr-Ausgabe, [[UNTRIM\|UnTRIM]]-Steuerdatei und dem Header der [[NetCDF]]-Datei (ncdump -h)
	* Ggf. Dateien zuschneiden, sodass die Ausgabezeitpunkte kontinuierlich fortlaufen mit		* Ggf. Dateien zuschneiden, sodass die Ausgabezeitpunkte kontinuierlich fortlaufen mit
	ncks -d nMesh2_data_time,min,max,[stride] in_file out_file		ncks -d nMesh2_data_time,min,max,[stride] in_file out_file

Ak3pscha: themis durch PROGHOME ersetzt

2020-05-15T13:13:04Z

themis durch PROGHOME ersetzt

← Nächstältere Version		Version vom 15. Mai 2020, 13:13 Uhr
Zeile 59:		Zeile 59:
	-> Befehle -> Kommandozeilenfenster öffnen		-> Befehle -> Kommandozeilenfenster öffnen
	* Suchpfad ergänzen:		* Suchpfad ergänzen:
	set PATH=%PATH%;~~\\themis\system\akprog~~\bin\win		set PATH=%PATH%;%PROGHOME%\bin\win
	* Ausführliche Hilfe zum Kommando einholen, z.B.:		* Ausführliche Hilfe zum Kommando einholen, z.B.:
	ncrcat		ncrcat

imported>Uliczka Ingrid: /* Typische Anwendungsfälle in der BAW */

2018-03-08T14:03:41Z

Typische Anwendungsfälle in der BAW

@@ Zeile 17: / Zeile 17: @@
 # Beispiel: ncrcat -h f1.nc f2.nc ... fn.nc result.nc (-h unterdrückt die Erzeugung bzw. Modifikation eines History-Attributs);
 # Mehr Information: [http://nco.sourceforge.net/nco.html#ncrcat-netCDF-Record-Concatenator ncrcat-netCDF-Record-Concatenator].
 ===Ausdünnen von [[NetCDF]]-Dateien entlang einer Dimension===

imported>Lang Guenther: Hinweis auf Fehler bei NCKS wurde entfernt

2018-02-01T07:52:39Z

Hinweis auf Fehler bei NCKS wurde entfernt

@@ Zeile 38: / Zeile 38: @@
 * char rotated_pole;
     rotated_pole:grid_north_pole_latitude = 90. ;
 ==Verfügbarkeit in der BAW-DH==

imported>Lang Guenther: /* Ncks-Fehler beim Extrahieren mit einer Schrittweite ungleich eins */ Text aktualisiert

2018-01-12T15:57:57Z

Ncks-Fehler beim Extrahieren mit einer Schrittweite ungleich eins: Text aktualisiert

← Nächstältere Version		Version vom 12. Januar 2018, 15:57 Uhr
Zeile 39:		Zeile 39:
	rotated_pole:grid_north_pole_latitude = 90. ;		rotated_pole:grid_north_pole_latitude = 90. ;

	====~~Ncks~~-Fehler beim Extrahieren mit einer Schrittweite ungleich eins====		====NCKS-Fehler beim Extrahieren mit einer Schrittweite (''Stride'') ungleich eins====
	Die folgende ~~Extraktion~~ kann unter bestimmten Voraussetzungen fehlerhaft ~~sein~~: ~~<BR>~~		Die folgende Verwendung von NCKS kann unter bestimmten Voraussetzungen (''Stride'' ungleich 1) zu fehlerhaft extrahierten Ergebnissen führen:
	ncks -d dim, min, max,[ stride] in_file out_file ~~<BR>~~
	~~Wer den Fehler auf einfache Weise vermeiden möchte, setze '''stride auf 1 oder verzichte auf stride'''. Dann sollte die Extraktion sicher funktionieren.<BR>~~		ncks -d dim, min, max,[ stride] in_file out_file
	~~Wer auf die Angabe des strides oder der Schrittweise größer 1 nicht verzichten kann, beachte dass ncks dann nur~~ für ~~die in CDL-Schreibweise letzte Dimension funktioniert. Dies ist die intern am schnellsten variierende Dimension<BR>~~
	~~Beispiel einer~~ Variablen mit mehreren Stationen (Dimension time_series) und mehreren Zeitpunkten (Dimension time).		Aktuell beobachtetes Verhalten für Variablen mit mehreren Stationen (Dimension ''time_series'') und mehreren Zeitpunkten (Dimension ''time'') bei Verwendung des o. g. Kommandos für dim=''time'' und ''Stride'' ungleich 1:
	* ~~water_level~~ (time_series, ''time'')		* '''Fehlfunktion''' bei Reihenfolge (''time_series'', ''time'');
	* ~~Nur für die o.g. Sortierung funktioniert der Befehl~~		* '''korrekte Funktion''' bei Reihenfolge (''time'', ''time_series'');
	* ncks -d ''time'',1,19,6 in_file out_file.		Wer den Fehler auf einfache Weise vermeiden möchte, setze ''Stride'' auf 1 oder verzichte auf ''Stride''. Falls auf eine Extraktion mit ''Stride'' ungleich 1 nicht verzichtet werden kann, muss die Reihenfolge der Dimensionen mit z. B.
	* Die Möglichkeiten bei abweichend sortierten Variablen werden noch untersucht.
			ncpdq -a dim1,dim2 in_file out_file

			verändert werden.

			Der Fehler wurde via [https://sourceforge.net/ SourceForge] an die Entwickler von NCO gemeldet. Wahrscheinlich benutzen wir eine veraltete Version von NCO (aktuell 4.6.1, empfohlen 4.7.1).

	==Verfügbarkeit in der BAW-DH==		==Verfügbarkeit in der BAW-DH==
	* Linux: nco-4.6.1 vom 06.08.2016		* Linux: nco-4.6.1 vom 06.08.2016

imported>Schade Peter: ncks-Fehler

2018-01-12T15:13:56Z

ncks-Fehler

← Nächstältere Version		Version vom 12. Januar 2018, 15:13 Uhr
Zeile 22:		Zeile 22:
	* ncks -d dim, min, max,[ stride] in_file out_file		* ncks -d dim, min, max,[ stride] in_file out_file
	* Mehr Optionen unter [https://linux.die.net/man/1/ncks].		* Mehr Optionen unter [https://linux.die.net/man/1/ncks].
			* Die Zählung erfolgt im C-Stil, d.h. das erste Feldelement hat den Wert 0.
			* Den weiter unten beschriebenen '''ncks-Fehler unbedingt beachten'''.
	==== Typisches zeitliches Ausdünnen synoptischer Modellergebnisse====		==== Typisches zeitliches Ausdünnen synoptischer Modellergebnisse====
	* Beispiel:		* Beispiel:
Zeile 37:		Zeile 39:
	rotated_pole:grid_north_pole_latitude = 90. ;		rotated_pole:grid_north_pole_latitude = 90. ;

			====Ncks-Fehler beim Extrahieren mit einer Schrittweite ungleich eins====
			Die folgende Extraktion kann unter bestimmten Voraussetzungen fehlerhaft sein: <BR>
			ncks -d dim, min, max,[ stride] in_file out_file <BR>
			Wer den Fehler auf einfache Weise vermeiden möchte, setze '''stride auf 1 oder verzichte auf stride'''. Dann sollte die Extraktion sicher funktionieren.<BR>
			Wer auf die Angabe des strides oder der Schrittweise größer 1 nicht verzichten kann, beachte dass ncks dann nur für die in CDL-Schreibweise letzte Dimension funktioniert. Dies ist die intern am schnellsten variierende Dimension<BR>
			Beispiel einer Variablen mit mehreren Stationen (Dimension time_series) und mehreren Zeitpunkten (Dimension time).
			* water_level (time_series, ''time'')
			* Nur für die o.g. Sortierung funktioniert der Befehl
			* ncks -d ''time'',1,19,6 in_file out_file.
			* Die Möglichkeiten bei abweichend sortierten Variablen werden noch untersucht.
	==Verfügbarkeit in der BAW-DH==		==Verfügbarkeit in der BAW-DH==
	* Linux: nco-4.6.1 vom 06.08.2016		* Linux: nco-4.6.1 vom 06.08.2016

imported>Schade Peter: , nach ncks -d dim

2018-01-09T09:53:23Z

, nach ncks -d dim

← Nächstältere Version		Version vom 9. Januar 2018, 09:53 Uhr
Zeile 24:		Zeile 24:
	==== Typisches zeitliches Ausdünnen synoptischer Modellergebnisse====		==== Typisches zeitliches Ausdünnen synoptischer Modellergebnisse====
	* Beispiel:		* Beispiel:
	ncks -d nMesh2_data_time 1, 19, 6 in_file out_file		ncks -d nMesh2_data_time,1,19,6 in_file out_file
	* Dadurch werden die Daten des ersten, siebten, dreizehntehn und neunzehnten Zeitschritts extrahiert. Die nicht von nMesh_data_time abhängigen Variablen werden unverändert übernommen.		* Dadurch werden die Daten des ersten, siebten, dreizehntehn und neunzehnten Zeitschritts extrahiert. Die nicht von nMesh_data_time abhängigen Variablen werden unverändert übernommen.
	==== Typisches räumliches Ausdünnen meteorologischer Anfangs- und Randwerte====		==== Typisches räumliches Ausdünnen meteorologischer Anfangs- und Randwerte====
	* Voraussetzung ist, dass die Daten auf zweidimensionalen, strukturierten Gittern vorliegen.		* Voraussetzung ist, dass die Daten auf zweidimensionalen, strukturierten Gittern vorliegen.
	* Schritt 1:		* Schritt 1:
	ncks -d rlon 600,900 iconeu.nc tmp_reduced_rlon.nc		ncks -d rlon,600,900 iconeu.nc tmp_reduced_rlon.nc
	* Schritt 2:		* Schritt 2:
	ncks -d rlat 200,500 tmp_reduced_rlon.nc iconeu.reduced_in_space.nc		ncks -d rlat,200,500 tmp_reduced_rlon.nc iconeu.reduced_in_space.nc
	* Damit wird ein "Quadrat" von 301 * 301 Werten in Längen- und Breitenrichtung augeschnitten. Die meteorologischen Felder lassen sich damit für das Anwendungsgebiet maßschneidern, was den anschließenden IO des Modelles deutlich reduzieren kann.		* Damit wird ein "Quadrat" von 301 * 301 Werten in Längen- und Breitenrichtung augeschnitten. Die meteorologischen Felder lassen sich damit für das Anwendungsgebiet maßschneidern, was den anschließenden IO des Modelles deutlich reduzieren kann.
	* Beim Ausschneiden ist zu beachten, dass die Daten unter Umständen in einem rotierten Gitter vorliegen. Wenn die rotated_pole Variable die folgende Eigenschaft hat, können die Werte ohne weitere Koordinatentransformation ausgeschnitten werden:		* Beim Ausschneiden ist zu beachten, dass die Daten unter Umständen in einem rotierten Gitter vorliegen. Wenn die rotated_pole Variable die folgende Eigenschaft hat, können die Werte ohne weitere Koordinatentransformation ausgeschnitten werden:

imported>Schade Peter am 5. Dezember 2017 um 10:21 Uhr

2017-12-05T10:21:22Z

← Nächstältere Version		Version vom 5. Dezember 2017, 10:21 Uhr
Zeile 32:		Zeile 32:
	* Schritt 2:		* Schritt 2:
	ncks -d rlat 200,500 tmp_reduced_rlon.nc iconeu.reduced_in_space.nc		ncks -d rlat 200,500 tmp_reduced_rlon.nc iconeu.reduced_in_space.nc
	* Damit wird ein "Quadrat" von 301 * 301 Werten in Längen- und Breitenrichtung augeschnitten. Die meteorologischen Felder lassen sich damit für das Anwendungsgebiet maßschneidern, was den anschließenden IO des Modelles deutlich reduzieren kann. Beim Ausschneiden ist ~~aber~~ zu beachten, dass die Daten unter Umständen in einem rotierten Gitter vorliegen. Wenn die rotated_pole Variable die folgende Eigenschaft hat, können die Werte ohne weitere Koordinatentransformation ausgeschnitten werden:		* Damit wird ein "Quadrat" von 301 * 301 Werten in Längen- und Breitenrichtung augeschnitten. Die meteorologischen Felder lassen sich damit für das Anwendungsgebiet maßschneidern, was den anschließenden IO des Modelles deutlich reduzieren kann.
			* Beim Ausschneiden ist zu beachten, dass die Daten unter Umständen in einem rotierten Gitter vorliegen. Wenn die rotated_pole Variable die folgende Eigenschaft hat, können die Werte ohne weitere Koordinatentransformation ausgeschnitten werden:
	* char rotated_pole;		* char rotated_pole;
	rotated_pole:grid_north_pole_latitude = 90. ;		rotated_pole:grid_north_pole_latitude = 90. ;

imported>Schade Peter: + Ausdünnen von NetCDF-Dateien entlang einer Dimension

2017-12-05T10:09:13Z

+ Ausdünnen von NetCDF-Dateien entlang einer Dimension

@@ Zeile 17: / Zeile 17: @@
 # Beispiel: ncrcat -h f1.nc f2.nc ... fn.nc result.nc (-h unterdrückt die Erzeugung bzw. Modifikation eines History-Attributs);
 # Mehr Information: [http://nco.sourceforge.net/nco.html#ncrcat-netCDF-Record-Concatenator ncrcat-netCDF-Record-Concatenator].
 ==Verfügbarkeit in der BAW-DH==
@@ Zeile 38: / Zeile 56: @@
 Die empfohlenen Zitate bei Verwendung der NCO Software sind:
-# Zender, C. S. (2008), Analysis of Self-describing Gridded Geoscience Data with [[netCDF]] Operators (NCO), Environ. Modell. Softw., 23(10),  1338-1342, doi:10.1016/j.envsoft.2008.03.004.
+# Zender, C. S. (2008), Analysis of Self-describing Gridded Geoscience Data with [[netCDF]] Operators (NCO), Environ. [[Modell]]. Softw., 23(10),  1338-1342, doi:10.1016/j.envsoft.2008.03.004.
-# Zender, C. S. (2014), netCDF Operator (NCO) User Guide, Version 4.4.8, [http://nco.sf.net/nco.pdf http://nco.sf.net/nco.pdf].
+# Zender, C. S. (2014), [[netCDF]] Operator (NCO) User Guide, Version 4.4.8, [http://nco.sf.net/nco.pdf http://nco.sf.net/nco.pdf].
 Das erste Zitat soll dann benutzt werden, wenn insbesondere auf Design, Zweck und Optimierung von NCO abgehoben wird. Das zweite soll dann verwendet werden, falls auf spezielle Eigenschaften der Software oder den ''User Guide'' selbst verwiesen wird.

imported>BAWiki Glossar: Edited by Wikibot

2017-09-29T10:29:34Z

Edited by Wikibot

← Nächstältere Version		Version vom 29. September 2017, 10:29 Uhr
Zeile 38:		Zeile 38:

	Die empfohlenen Zitate bei Verwendung der NCO Software sind:		Die empfohlenen Zitate bei Verwendung der NCO Software sind:
	# Zender, C. S. (2008), Analysis of Self-describing Gridded Geoscience Data with [[netCDF]] Operators (NCO), Environ. [[Modell]]. Softw., 23(10), 1338-1342, doi:10.1016/j.envsoft.2008.03.004.		# Zender, C. S. (2008), Analysis of Self-describing Gridded Geoscience Data with [[netCDF]] Operators (NCO), Environ. Modell. Softw., 23(10), 1338-1342, doi:10.1016/j.envsoft.2008.03.004.
	# Zender, C. S. (2014), netCDF Operator (NCO) User Guide, Version 4.4.8, [http://nco.sf.net/nco.pdf http://nco.sf.net/nco.pdf].		# Zender, C. S. (2014), netCDF Operator (NCO) User Guide, Version 4.4.8, [http://nco.sf.net/nco.pdf http://nco.sf.net/nco.pdf].
	Das erste Zitat soll dann benutzt werden, wenn insbesondere auf Design, Zweck und Optimierung von NCO abgehoben wird. Das zweite soll dann verwendet werden, falls auf spezielle Eigenschaften der Software oder den ''User Guide'' selbst verwiesen wird.		Das erste Zitat soll dann benutzt werden, wenn insbesondere auf Design, Zweck und Optimierung von NCO abgehoben wird. Das zweite soll dann verwendet werden, falls auf spezielle Eigenschaften der Software oder den ''User Guide'' selbst verwiesen wird.