Installation NetCDF4 mit HDF5
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Die Quellen für NetCDF kommen von UniData, die Quellen für HDF5 von The HDF group. Das lokale Verzeichnis für die C-Quellen ist $PROGHOME/C/lib/.
Installation
Überblick
Für NetCDF in der Version 4.1.2 liegen im Verzeichnis $PROGHOME/C/lib/netcdf/netcdf-4.1.2/ zwei README-Dateien, die zugleich die zentralen Installationsskripte darstellen. Ebenso für HDF5 im Verzeichnis $PROGHOME/C/lib/hdf5/:
- README.TXT für die Standard-Installation
- README_MPI.TXT für eine MPI-parallele Installation
Trotz der Dateiendung können beide Dateien direkt als Skript auf kronos ausgeführt werden. Sie setzen Umgebungsvariable und verzweigen dann in das Unterverzeichnis xe bzw. xe_mpi. Hier warten ein configure-Skript und ein Makefile auf die Verwendung durch das README-Skript, um die Installation durchführen zu können.
Archive
Nach erfolgreicher Installation stehen die folgenden Archive unter $PROGHOME/lib/xe/netcdf4.1.2/lib/ zur Verfügung:
- libnetcdf
- libnetcdff : Fortran-Schnittstelle für NetCDF
- libnetcdf_c++4 : C++ Schnittstelle für NetCDF-Version 4
- libnetcdf_c++ : C++ Schnittstelle für NetCDF
Zusätzliche Pakete
Die Umgebungsvariable $netcdf listet alle zum Linken eines Executables notwendigen Archive. Zusätzlich zu NetCDF werden die folgenden Pakete eingebunden:
- HDF5 (Version 1.8.6) Installationsverzeichnis $PROGHOME/lib/xe/hdf5-1.8.6/lib
- Archiv libhdf5_hl.a
- Archiv libhdf5.a
- CURL (Version 7.21.6) Installationsverzeichnis $PROGHOME/lib/xe/curl-7.21.6/lib
- Archiv libcurl.a
- ZLIB Installationsverzeichnis $PROGHOME/lib/linux/zlib/lib
- Archiv libz.a